En réalité, dans un végétal, plusieurs parties respirent : la fleur, mais aussi la tige, les feuilles et éventuellement les fruits.

La respiration d'un végétal est possible grâce à de petites ouvertures dispersées un peu partout : on les appelle les stomates. Ces orifices présents dans l'épiderme (le tissu de protection) permettent les échanges gazeux entre la plante et l'air. Par les stomates, le végétal absorbe l'oxygène et rejette du gaz carbonique (dioxyde de carbone) et de la vapeur d'eau.

On pense à tort que cette respiration est uniquement nocturne. Cette confusion est due à un autre type de respiration de la plante : la photosynthèse. Là, le phénomène est inverse : le végétal absorbe le gaz carbonique et rejette de l'oxygène. Comme cette photosynthèse demande de la lumière, elle n'a lieu que le jour et s'arrête la nuit. Cela donne l'impression que la plante respire ensuite dès qu'il fait nuit. En réalité, la respiration a lieu nuit et jour.